这是一段尘封多年的传奇往事，发生在一个由帮会、租界、平民、警匪、日军、特工们组成的传奇上海。 1931年，九一八的血雨腥风刮进了上海的十里洋场，三个来自不同家庭的年轻人因缘际会，在上海滩相遇。两个男孩一个出身于上海里弄的普通人家，一个被国民党军校校长收养，他们的小妹则是漕帮大佬最心爱的女儿。时代的洪流将他们扔进命运的熔炉，他们的青春、爱情、理想、信仰都受到了严酷的淬炼。随着他们身世之谜的逐步揭开，一幅巨大的上海俗世画卷也缓缓铺陈在眼前。当日本蚕食中国的阴谋浮出水面，当残酷的命运撕裂家庭与感情，当恐怖的谍影重重笼罩，党派斗争相互倾轧，在上海这座无助的孤岛上，他们兄妹三人也走上了完全不同的人生道路。 1932年1月，严冬肃杀，日军终于对上海发动了蓄谋已久的攻势。无数的血性上海民众自发加入了这场旷日持久的战争中，他们与19路军同仇敌忾，不懈努力，谱写了一曲壮烈的悲歌，三个年轻人的命运也一起在此交缠纠葛，走向终点。
20世纪40年代，古老的华夏大地正遭受日本帝国主义铁蹄的蹂躏。各方势力盘根错节，在这片土地上上演了连番的厮杀和值得大书特书的惊世传奇。九河下梢天津卫，万国租界所在地，同时也是各方角力最为激烈的城市之一。在法租界经营东华洋行经理沈西林（黄渤 饰）左右逢源，财源广进，风流倜傥，八面玲珑。世间对他有着各种各样的猜测，但只有沈西林自己才知道，他的生命中不仅只有生意，更肩负着家国的命运。他是汪伪政权驻天津情报机构主任，与交际花莫燕萍（袁泉 饰）经手多少攸关天下的重要情报。除此之外，沈西林还有一个至关重要的身份不为人知。
林小纯（何蓝逗 饰）是刚刚踏进大学校园的新鲜人，刚来报到的第一天，她就在女生宿舍里碰见了室友陈晨晨（虞书欣 饰）的男友高霖（赵志伟 饰），两人之间因为误会闹出了一大串的笑料。之后，林小纯接连见到了自己的其他三名室友，五个女孩都是人生头一次离开熟悉的环境，过上集体生活。
二十一集电视系列剧《命案十三宗》取材于近几年发生的十三宗真实命案，经改编创作而成，主要情节与人物都是真实的。摄制组对这十三宗命案的凶犯做了三十多个小时的电视采访记录，并将这些采访作为一个部分放在剧中，与故事情节有机地结合成一个完整的影片。他们都说肯定不想杀人，但又承认自己后来确实杀了人，那是怎样的过程？是什么因素造成了惨剧的发生呢？他们绝非成心作恶之人，使他们走到这一步的就是人类所共有的人性弱点，自私、嫉妒、无知、狭隘、愚昧……断送了他们原本平静幸福的生活。被他们杀害的人痛苦地死去了，他们还活着，却没有了快乐。我们可能也曾面临过困境、也曾受到过伤害和由此产生的反抗，那种维护尊严的欲望和这些杀人者都是相同的，甚至更强烈。但有所不同的是，他们都采取了一种错误的方式。企图摆脱那种困境，却不料将自己置身于一个根本无法挽回的绝境，剥夺了给自己造成困境的人的生命，成了一名杀人犯。于是他们成了故事中的人。
民国初年，江南古镇陶家大院。这日陶家上下正为后院古井冒出伴有腥味的绿水怪事胆战心惊，在上海做生意6年不曾归家的陶老爷（李立群）的书信送至，称会在家中过六十大寿。大太太（宋春丽）掐指算计，老爷生日不过后天。陶家人开始忙作一团，却多在掩盖6年来的是是非非。但他们迎来的只是一具面目模糊的尸体及一个身着孝衣的纤细女子（赵琳）。女子名叫仪萍，自称是五姨太，并言死者正是陶老爷，她的话即刻在陶家引起轩然大波。其后，二姨太桂云（史可）、三姨太雅芝（何赛飞）、四姨太玉翠（高蓓蓓）及大少爷陶书利（修庆）、三姨太的情人大梅子（陈笑非）等人与她展开斗智战，但她并不像他们一样是为陶家家产，而她与无心参战的二少爷陶书远（贾一平）之间，似也有旁人参不透的迷情。
故事发生在锦江医科大学附属医院之中，申赫（罗云熙 饰）是一名在那里工作的儿科外科医生，拥有英俊外貌和高超医术的他深得患者与领导的信赖，大家都认为他将会是科室一把手的接班人。申赫的妻子唐雨佳（孙铱 饰）也是一名医生，此时正在儿科进行为期一年的轮转。唐雨佳的梦想并不在儿科，她希望能够成为一名出色的外科医生。唐雨佳在儿科的日子并不好过，因为她有一个非常严厉的师父叶梅（曾黎 饰），还承担着巨大的压力。实际上，叶梅的初恋情人褚子键（凌潇肃 饰）也在儿科工作，并且是儿科的一把手，可是，褚子键虽然在职场上风生水起，却遭遇了严重的家庭危机。
